Las disputas que mantuvieron el ministro de Industria, Miguel Sebastián, y la ministra de Ciencia e Innovación, Cristina Garmendia, a mediados de 2008 por el control del Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI) se han reproducido en los últimos meses y están detrás de la salida de Carlos Martínez de la Secretaría de Estado de Investigación.

Uno de los detonantes ha sido la tensa relación que ha mantenido con Teresa Santero, secretaria general de Industria e interlocutora con el Ministerio de Ciencia para las competencias aeroespaciales, que aún dependen de Industria. Los roces con Garmendia, a raíz del recorte presupuestario que han sufrido las políticas de I+D+i en 2010, también han pesado en la decisión. Martínez será sustituido por Felipe Petriz.